Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP1P63208 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP1P63208 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms