Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms