Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
RPS29P62273 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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