Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCS1P62166 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NCS1P62166 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms