Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ERVS71-1P61550 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms