Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP6P55212 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP6P55212 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP6P55212 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP6P55212 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP6P55212 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP6P55212 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP6P55212 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP6P55212 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP6P55212 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP6P55212 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP6P55212 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP6P55212 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms