Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DAP3P51398 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms