Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSRP3P50461 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CSRP3P50461 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms