Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA4P48169 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms