Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPOP42166 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPOP42166 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms