Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5CP41229 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms