Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms