Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms