Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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