Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5A1P25705 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms