Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms