Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM21P19474 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms