Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNNI3P19429 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms