Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRAP18433 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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PTPRAP18433 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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PTPRAP18433 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRAP18433 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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