Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSPP15924 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSPP15924 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSPP15924 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSPP15924 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSPP15924 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSPP15924 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSPP15924 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSPP15924 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSPP15924 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSPP15924 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSPP15924 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSPP15924 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DSPP15924 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSPP15924 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DSPP15924 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DSPP15924 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DSPP15924 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms