Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BMP4P12644 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BMP4P12644 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BMP4P12644 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BMP4P12644 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BMP4P12644 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BMP4P12644 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BMP4P12644 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BMP4P12644 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms