Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms