Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms