Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLA1P09884 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
POLA1P09884 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLA1P09884 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLA1P09884 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLA1P09884 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLA1P09884 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLA1P09884 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLA1P09884 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLA1P09884 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLA1P09884 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLA1P09884 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLA1P09884 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLA1P09884 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLA1P09884 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLA1P09884 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLA1P09884 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
POLA1P09884 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
POLA1P09884 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLA1P09884 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
POLA1P09884 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLA1P09884 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLA1P09884 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
POLA1P09884 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLA1P09884 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLA1P09884 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
POLA1P09884 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLA1P09884 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLA1P09884 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLA1P09884 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLA1P09884 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLA1P09884 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POLA1P09884 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLA1P09884 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLA1P09884 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLA1P09884 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POLA1P09884 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLA1P09884 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLA1P09884 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLA1P09884 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLA1P09884 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLA1P09884 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms