Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPBP07199 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms