Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEFMP07197 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEFMP07197 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEFMP07197 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms