Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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