Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHF1O43189 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHF1O43189 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF1O43189 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms