Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCAO15360 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCAO15360 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCAO15360 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCAO15360 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCAO15360 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCAO15360 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCAO15360 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCAO15360 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCAO15360 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCAO15360 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCAO15360 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCAO15360 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCAO15360 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCAO15360 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCAO15360 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCAO15360 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCAO15360 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCAO15360 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCAO15360 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCAO15360 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCAO15360 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCAO15360 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCAO15360 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCAO15360 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCAO15360 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCAO15360 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCAO15360 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCAO15360 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCAO15360 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCAO15360 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCAO15360 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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