Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3C2AO00443 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3C2AO00443 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms