Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2K7ER74 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms