Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms