Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPA5E9PKD4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms