Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA2E9PIF3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms