Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E9PBE3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E9PBE3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E9PBE3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E9PBE3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E9PBE3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E9PBE3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E9PBE3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E9PBE3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E9PBE3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E9PBE3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E9PBE3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E9PBE3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E9PBE3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E9PBE3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E9PBE3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms