Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HNRNPCL3B7ZW38 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms