Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDR42E2A6NKP2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SDR42E2A6NKP2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDR42E2A6NKP2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDR42E2A6NKP2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDR42E2A6NKP2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDR42E2A6NKP2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SDR42E2A6NKP2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDR42E2A6NKP2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDR42E2A6NKP2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDR42E2A6NKP2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDR42E2A6NKP2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDR42E2A6NKP2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms