Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms