Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAF6Q9Y4K3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms