Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMCC3Q9ULS5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMCC3Q9ULS5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms