Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms