Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms