Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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