Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms