Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CFDP1Q9UEE9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFDP1Q9UEE9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms