Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms