Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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COPS7AQ9UBW8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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COPS7AQ9UBW8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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