Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms