Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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