Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABI3Q9P2A4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms